MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 56940

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015387	TGG	2	6	115865	115870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949660
3002	NC_015387	CCT	2	6	115971	115976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949660
3003	NC_015387	TGC	2	6	116018	116023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949660
3004	NC_015387	CCTGCC	2	12	116073	116084	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	328949660
3005	NC_015387	GGGA	2	8	116088	116095	25 %	0 %	75 %	0 %	328949660
3006	NC_015387	GCG	3	9	116098	116106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949660
3007	NC_015387	G	6	6	116121	116126	0 %	0 %	100 %	0 %	328949660
3008	NC_015387	TGC	2	6	116132	116137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949660
3009	NC_015387	TTG	2	6	116140	116145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949660
3010	NC_015387	GTTT	2	8	116202	116209	0 %	75 %	25 %	0 %	328949660
3011	NC_015387	TGG	2	6	116213	116218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949660
3012	NC_015387	GCGTAC	2	12	116245	116256	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	328949660
3013	NC_015387	TGC	2	6	116258	116263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949660
3014	NC_015387	CCA	2	6	116285	116290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949660
3015	NC_015387	TGGGG	2	10	116338	116347	0 %	20 %	80 %	0 %	328949660
3016	NC_015387	GC	3	6	116418	116423	0 %	0 %	50 %	50 %	328949660
3017	NC_015387	AG	3	6	116453	116458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_015387	G	6	6	116477	116482	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_015387	TGA	2	6	116502	116507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949661
3020	NC_015387	C	6	6	116637	116642	0 %	0 %	0 %	100 %	328949661
3021	NC_015387	GCC	2	6	116675	116680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949661
3022	NC_015387	C	6	6	116713	116718	0 %	0 %	0 %	100 %	328949661
3023	NC_015387	CCT	3	9	116817	116825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949662
3024	NC_015387	CG	3	6	116957	116962	0 %	0 %	50 %	50 %	328949662
3025	NC_015387	AGG	2	6	116984	116989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949662
3026	NC_015387	CGGG	2	8	116991	116998	0 %	0 %	75 %	25 %	328949662
3027	NC_015387	CCA	2	6	117015	117020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949662
3028	NC_015387	CCT	2	6	117033	117038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949662
3029	NC_015387	GC	3	6	117086	117091	0 %	0 %	50 %	50 %	328949662
3030	NC_015387	CTCG	2	8	117193	117200	0 %	25 %	25 %	50 %	328949662
3031	NC_015387	TCC	2	6	117284	117289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949662
3032	NC_015387	GC	3	6	117307	117312	0 %	0 %	50 %	50 %	328949662
3033	NC_015387	GCG	2	6	117316	117321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949662
3034	NC_015387	CG	3	6	117320	117325	0 %	0 %	50 %	50 %	328949662
3035	NC_015387	G	6	6	117393	117398	0 %	0 %	100 %	0 %	328949662
3036	NC_015387	CGCGCT	2	12	117432	117443	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	328949662
3037	NC_015387	CG	3	6	117444	117449	0 %	0 %	50 %	50 %	328949662
3038	NC_015387	CG	3	6	117451	117456	0 %	0 %	50 %	50 %	328949662
3039	NC_015387	GAG	2	6	117466	117471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949662
3040	NC_015387	TCG	3	9	117503	117511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949662
3041	NC_015387	GGC	2	6	117568	117573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949662
3042	NC_015387	CGG	2	6	117600	117605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949662
3043	NC_015387	CG	3	6	117748	117753	0 %	0 %	50 %	50 %	328949662
3044	NC_015387	CCG	2	6	117789	117794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949662
3045	NC_015387	CTT	2	6	117804	117809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949662
3046	NC_015387	CGC	2	6	117879	117884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949662
3047	NC_015387	CGG	2	6	117935	117940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949662
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3049	NC_015387	GAG	2	6	117952	117957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949662
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3051	NC_015387	AGC	2	6	118049	118054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949662
3052	NC_015387	CGC	2	6	118106	118111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949663
3053	NC_015387	GC	3	6	118156	118161	0 %	0 %	50 %	50 %	328949663
3054	NC_015387	CCA	2	6	118181	118186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949663
3055	NC_015387	CGGC	2	8	118257	118264	0 %	0 %	50 %	50 %	328949663
3056	NC_015387	GAG	2	6	118269	118274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949663
3057	NC_015387	CCT	2	6	118385	118390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949663
3058	NC_015387	CGG	2	6	118427	118432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949663
3059	NC_015387	ATC	2	6	118455	118460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949663
3060	NC_015387	C	6	6	118465	118470	0 %	0 %	0 %	100 %	328949663
3061	NC_015387	GA	3	6	118471	118476	50 %	0 %	50 %	0 %	328949663
3062	NC_015387	GAT	2	6	118518	118523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949663
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3065	NC_015387	ATC	2	6	118660	118665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949663
3066	NC_015387	AGCTCG	2	12	118684	118695	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	328949663
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3070	NC_015387	CGA	2	6	118821	118826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949664
3071	NC_015387	GTC	2	6	118837	118842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949664
3072	NC_015387	CGC	2	6	118874	118879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949664
3073	NC_015387	GAT	2	6	118888	118893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949664
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3077	NC_015387	GGA	2	6	119258	119263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949665
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3090	NC_015387	GCG	2	6	119611	119616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949665
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3092	NC_015387	G	7	7	119675	119681	0 %	0 %	100 %	0 %	328949665
3093	NC_015387	GTT	2	6	119705	119710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949665
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3095	NC_015387	CCGG	2	8	119759	119766	0 %	0 %	50 %	50 %	328949665
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3099	NC_015387	ATA	2	6	119900	119905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_015387	GCG	2	6	119967	119972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_015387	GCGGT	2	10	120007	120016	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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3103	NC_015387	CCG	2	6	120067	120072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_015387	AGGG	2	8	120083	120090	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_015387	CTG	2	6	120108	120113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_015387	GAC	2	6	120155	120160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_015387	CGG	2	6	120194	120199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_015387	GCG	2	6	120223	120228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_015387	CTG	2	6	120308	120313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_015387	CGG	2	6	120318	120323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_015387	GCGG	2	8	120415	120422	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3112	NC_015387	G	6	6	120426	120431	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_015387	GT	3	6	120452	120457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_015387	GGTT	2	8	120487	120494	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_015387	GCG	2	6	120501	120506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_015387	GGTGG	2	10	120520	120529	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_015387	GCG	2	6	120788	120793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_015387	CGG	2	6	120830	120835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_015387	G	6	6	120890	120895	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_015387	TGG	2	6	120929	120934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_015387	GGGAG	2	10	121068	121077	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_015387	TGT	2	6	121128	121133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_015387	TGG	2	6	121517	121522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_015387	AAC	2	6	121569	121574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_015387	CCG	2	6	121580	121585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_015387	GCT	2	6	121628	121633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_015387	AGG	2	6	121643	121648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3132	NC_015387	GTC	2	6	121916	121921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3244	NC_015387	G	6	6	126694	126699	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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